ИССЛЕДОВАНИЕ НАБОРОВ ГЕНОВ СУПЕРАНТИГЕНОВ У РАЗЛИЧНЫХ М-ТИПОВ STREPTOCOCCUS PYOGENES

Минко А.Г., Аджиева А.А., Данилина Г.А., Данилова Т.А, Жуховицкий В.Г.

 ФГБУ «НИЦЭМ им. Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России, Москва, Россия

Цель:

Идентификация наборов генов суперантигенов и сопоставление их с различными М-типами Streptococcus pyogenes (стрептококков группы А, СГА).

Материалы и методы:

В работе изучено 40 штаммов СГА, полученных от пациентов ГКБ им. С.П. Боткина г. Москвы. Штаммы выращивали на кровяном агаре с добавлением 5% бараньей крови в атмосфере 5% СО2. Групповую принадлежность штаммов СГА идентифицировали методом латекс-агглютинации с помощью набора Slidex Streptoplus (bioMerieux, Франция). Определение М-типов СГА проводили согласно методике В. Beall et al., 2004, включающей в себя амплификацию emm-гена и секвенирование полученного ампликона. Определение генов суперантигенов (speA, speC, speG, speH, speI, speK, speL, speM, smeZ, ssa) проводили методом мультипраймерной ПЦР по Borek AL et al, 2012.

Результаты:

В ходе работы выявлено 3 штамма типа М1, 5 штаммов типа М3, 2 – М4, 1 – М6, 3 – М12, 2 – М41, 1 – М73, 1 – М74, 7 – М75, 3 – М77, 1 – М81, 1 – М84, 4 –М89, 1 – М90. У остальных 5 штаммов М-тип не определён, так как отсутствовала амплификация emm-гена. Обнаружено, что ген speB определялся с наибольшей частотой (100%), немного реже выявлялись гены smeZ и speG (97,5% и 87,5% соответственно). Ген speA выявлен в 47,5% случаев. Гены speJ, speH, speK, speL, speM выявлялись с одинаковыми частотами: 20%, 20%, 22,5%, 20%, 20% соответственно, гены speI и ssa – по 10%. Интересно, что гены speL и speM определялись в виде пары у всех исследуемых штаммов, а гены speJ, speH и speK определялись вместе с геном speG. Одинаковые наборы генов суперантигенов содержались: у штаммов М1 – в 100% случаев, тот же набор генов определен у штаммов М41 – 50%; у М3 – 100%, тот же набор генов у М12 – 33%; у М75 – 75%; у М89 – 75%; у М12 – 67%, тот же набор генов у М77 – 50%. Остальные штаммы имели индивидуальные наборы генов суперантигенов. Один из штаммов М77 содержал только один ген smeZ.

Выводы:

  1. Из 40 изученных штаммов S. pyogenes 35 были отнесены к 14 различным М-типам; 5 штаммов отнесены к нетипируемым.
  2. С помощью мультипраймерной ПЦР у всех 40 клинических штаммов S. pyogenes обнаружены суперантигены.
  3. В ходе работы были выявлены штаммы, относящиеся к типам М1, М3, М12, М75 и М89, имеющие одинаковые наборы суперантигенов и образующие кластеры.