ГЕНОТИПЫ И НОСИТЕЛЬСТВО КАРБАПЕНЕМАЗ У КАРБАПЕНЕМОРЕЗИСТЕНТНЫХ KLEBSIELLA PNEUMONIAE, ВЫДЕЛЕННЫХ У ДЕТЕЙ В Г. МОСКВЕ

Цель:

Определить популяционную структуру и молекулярно-генетические механизмы карбапенеморезистентности госпитальных штаммов K. pneumoniae.

Материалы и методы:

Для изучения отбирали карбапенеморезистентные (карба-Р) изоляты K. pneumoniae (минимальная подавляющая концентрация [МПК] имипенема и/или меропенема >8 мг/л), выделенные у детей в 2012-2017 гг. в одном стационаре г. Москвы. Видовую идентификацию проводили на масс-спектрометре MALDI-TOF-MS (Microflex, Bruker Daltonics). Для скрининга групп генов карбапенемаз применяли метод ПЦР-РВ, используя наборы «АмплиСенс® MDR MBL-FL» (IMP, NDM, VIM) и «АмплиСенс® MDR KPC/OXA-FL» (KPC, OXA-48-подобные) производства ЦНИИЭ Роспотребнадзора. Тип карбапенемаз определяли при помощи секвенирования по Сэнгеру. Сиквенс-типы (ST) определяли методом мультилокусного сиквенс-типирования (МЛСТ).

Результаты:

Всего проанализировали 106 карба-Р изолятов K.pneumoniae, 102 (96,2%) из которых были носителями, по меньшей мере, одного из исследованных генов карбапенемаз. У 93 (88%) изолятов был обнаружен ген blaoxa-48-like, причем у четырех изолятов – в сочетании с носительством blaNDM-1. Еще семь (6%) изолятов имели только blaNDM-1, а два (2%) – только blaKPC-3. У четырех (3,8%) карба-Р изолятов карбапенемазы обнаружены не были. Исследованную популяцию карба-Р K.pneumoniae составили 15 сиквенс-типов, среди которых лидировали ST307 (38%), ST395 (18%), ST48 (16%) и ST377 (12%) Носителями blaNDM-1 были изоляты ST 395 (5), ST 377 (2), ST 147 (2), ST 307 (1) и ST 461 (1), а blaKPC-3 была обнаружена у двух ST 15-изолятов.

Выводы:

Наличие blaoxa-48-like карбапенемазы было наиболее распространённым механизмом резистентности среди карба-Р изолятов K. pneumoniae. Вызывает обеспокоенность высокая доля изолятов-носителей blaNDM-1 (10,4%). Впервые была выделена карбапенемаза KPC-3 в данном стационаре г. Москвы. Основу генетической структуры исследованной популяции карба-Р K.pneumoniae составляет небольшое число международных клонов высокого эпидемического риска.