ВЫЯВЛЕНИЕ ДВУХ НОВЫХ СИКВЕНС-ТИПОВ ST3668 И ST3669 У АМПИЦИЛЛИНОРЕЗИСТЕНТНЫХ KLEBSIELLA PNEUMONIAE
Асташкин Е.И., Карцев Н.Н., Новикова Т.С., Мицевич И.П., Федюкина Г.Н., Фурсова Н.К.
ФБУН «ГНЦ прикладной микробиологии и биотехнологии», Оболенск, Россия
Цель:
Идентификация генетических линий изолятов Klebsiella pneumoniae, описание двух новых сиквенс-типов.
Материалы и методы:
Видовую идентификацию бактерий осуществляли на приборе MALDI-TOF Biotyper (Bruker, Германия); чувствительность к 18 антибактериальным препаратам (АП) 6 функциональных классов (бета-лактамы, аминогликозиды, фторхинолоны, сульфаниламиды, тетрациклины и фениколы) – на приборе Vitek-2 Compact (bioMerieux, США). Гены blaCTX-M, blaTEM, blaSHV, blaOXA, blaVIM, blaKPC, blaNDM, int1, int2, rmpA, aer, kfu, uge, wabG, fimH, allS, stx1 и stx2 детектировали методом ПЦР. Сиквенс-типы определяли по протоколу базы данных bigsdb.pasteur.fr.
Результаты:
Изоляты K. pneumoniae (n = 12) выделены в детском учреждении Кировской области из продуктов питания, объектов внешней среды, от ребенка и сотрудника пищеблока. Все изоляты были чувствительны к использованным АП, кроме ампициллина, при этом из тестируемых генетических детерминант антибиотикорезистентности выявлен только ген blaSHV. Все изоляты характеризовались одинаковыми наборами генов вирулентности: uge, wabG, fimH и allS, которые характерны для ветви классических K. pneumoniae. Идентифицированы 2 известных сиквенс-типа клебсиелл: ST36 (1 изолят от сотрудника пищеблока), который нередко выделяется от людей в Европе, Азии, Австралии, Америке, и ST872 (6 изолятов из пищевых продуктов и объектов внешней среды), который ранее был представлен только одним изолятом, выделенным от дикой птицы в США. Выявлены новые сиквенс-типы ST3668 (4 изолята из пищевых продуктов и объектов внешней среды) и ST3669 (1 изолят, выделенный от ребенка). Аллельные профили ST3668 (gapA2, infB1, mdh2, pgi1, phoE7, rpoB4, ton7) и ST3669 (gapA2, infB1, mdh6, pgi1, phoE7, rpoB7, ton7) генетически близки между собой и c ST36 (отличия по генам mdh и rpoB), который описан во многих регионах мира.
Выводы:
Внебольничные изоляты K. pneumoniae, выделенные в Кировской области, характеризуются генетическим разнообразием. Выявлены 4 сиквенс-типа, из которых 2 новые, с присвоенными им базой данных Института Пастера (Париж, Франция) номерами ST3668 и ST3669. Полученные результаты важны для оценки значимости и эпидемиологического распространения генетических линий K. pneumoniae. Работа выполнена в рамках отраслевой НИР Роспотребнадзора.